O Clã Senju é um Clã muito antigo, na qual seu líder era Senju Hashirama, também tinha como membros aquele que viria a ser o Segundo Hokage. Foi revelado recentemente que na verdade Konohagakure no Sato foi criado a partir da junção do Clã Senju e o Clã Uchiha, em que Uchiha Madara era o líder. Por problemas políticos Senju Hashirama foi nomeado o primeiro Hokage e Uchiha Madara se enfrentaram no Vale do Fim (vale no qual Uzumaki Naruto e Uchiha Sasuke se enfrentaram), sendo que Senju Hashirama saiu vitorioso.
 

É um clã muito famoso dentro e fora do País do Fogo, onde residem. São úteis pela sua habilidade de controlar insetos de variados tipos. Apesar de clãs parecidos existirem em outros Países, o Clã Aburame é o maior e o mais famoso. Para ganhar a ajuda dos pequenos seres vivos, são postos no corpo quando ainda é pequeno. Eles se alimentam do chakra do ninja, e em troca são usados na batalha pela manipulação do chakra.

Também são um Clã conhecido na Vila Oculta da Folha, pois o clã possui uma loja de flores em Konoha chamada Yamanaka Flower Shop. Loja mostrada diversas vezes no Anime e no Mangá.

Esse clã de Konoha é composto por membros de corpos obesos. Esse fator é a principal vantagem deles. Com o Baika no Jutsu, eles aumentam o tamanho e peso do corpo, e com isso ganham resistência de ataques e podem executar taijutsus de grande potência, como o Nikudan Sensha. Dentro do clã existem outros jutsus relacionados ao uso de seus corpos, mas geralmente outros ninjutsus são usados em casos extremos, e com o auxílio das Pílulas Akimichi.

É um clã do País do Fogo respeitado, com o uso de cães como companheiro nas lutas. O ninja recebe seu cão ainda pequeno. Os dois começam a criar uma existência amigável, até ao ponto do ninja entender o que o seu mascote tenta expressar por latidos e gestos. Os dois desenvolvem confiança entre si.

Clã Koori é o suposto clã de quem Haku é membro, assim como sua mãe. Após a guerra civil no País da Água, todos se revoltaram contra os herdeiros de Kekkei Genkai, por considerarem perigosos demais para os habitantes. Foi por essa razão que o Clã Kaguya, também originário da Vila Oculta da Névoa, atacou os habitantes e acabou extinto.

O Clã diretamente descendente do criador dos jutsus, o Eremita dos 6 Caminhos. Grande facilidade em qualquer técnica Ninjutsu. Possui técnicas incrivelmente poderosas, e em campo de batalha, o Rin'negan se mostra ser realmente a origem das artes ninjas.

Não é um Clã muito grande. Na história de Konoha, é lembrado por deter um conhecimento medicinal excepcional. Tsunade recorreu a tal conhecimento para poder salvar Akimichi Chouji. No entanto, é mais conhecido por suas técnicas serem usadas para segurar um Shinobi (Ninja), enquanto chegava o time de apoio. Por isso, suas técnicas nunca foram próprias para batalha.

Manipulação da Areia, originalmente do País do Vento. Sabaku significa deserto, possui a mobilidade de ataque e defesa, e é conhecido como a Defesa Absoluta. Jutsus ferozes fazem parte do contra ataque. Em níveis mais altos, é capaz de transformar rochas em areia para usar em combate e ainda extrair minerais de alta resitência para montar suas defesas.

Chikamatsu é o Lendário criador do estilo Kugutsu, o uso de mariontes em combates ninja. Criou a maioria das marionetes usadas até hoje, que realizam performances de defesa, ataque e combinação de marionetes.

Shouton é uma Kekei Genkai, em que o usuário consegue cristalizar qualquer elemento ou objeto e ainda pode moldar no formato que desejar em niveis superiores. Pode criar armas e barreiras de defesa. O Cristal criado desse modo, é muito resistente, assemelhando-se a dureza do diamante.

O Terceiro Kazekage foi capaz de unir elementos para, manipular areia, porém com um campo eletromagnético, usar pó de ferro (ou limalha, areia) e executar ataques maciços e defesas muito resistentes, em niveis mais altos, consegue controlar uma quantidade gigantesca de ferro.